1株导致种鸭产蛋下降的新型鸭环状病毒分离与鉴定

doi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2026.01.035

中国畜牧兽医 ›› 2026, Vol. 53 ›› Issue (1): 390-401.doi: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2026.01.035

1株导致种鸭产蛋下降的新型鸭环状病毒分离与鉴定

李冰¹^,²(), 许明清³(), 郝东敏²^,⁴(), 王友⁵(), 李慧慧¹, 毛明田¹^,⁶, 吴冕¹^,⁶, 鹿程光¹^,⁶, 唐静¹, 梁素芸¹, 郭占宝¹^,⁶, 周正奎¹, 侯水生¹(), 唐熠¹^,⁶()

^1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193
^2.河南农业大学，郑州 450046
^3.山东和康源生物育种股份有限公司，济南 250001
^4.安徽强英食品集团有限公司，宿州 235323
^5.瑞普生物股份有限公司，天津 300308
^6.山东农业大学，泰安 271018

收稿日期:2025-07-13 出版日期:2026-01-05 发布日期:2025-12-26
通讯作者: 侯水生,唐熠 E-mail:libing_2025@163.com;237756683@qq.com;674913654@qq.com;wangyou@ringpu.com;houss@263.net;tangyi@caas.cn
作者简介:李冰，E-mail：libing_2025@163.com
许明清，E-mail：237756683@qq.com
郝东敏，E-mail：674913654@qq.com
王友，E-mail：wangyou@ringpu.com
第一联系人：共同第一作者
基金资助:
山东省科技型中小企业创新能力提升工程(2022TSGC1290);山东省科技型中小企业创新能力提升工程(2022TSGC2400);国家水禽产业技术体系(CARS-42-19)

Isolation and Identification of a Novel Duck Orbivirus Causing Decreased Egg Production in Breeding Ducks

LI Bing¹^,²(), XU Mingqing³(), HAO Dongmin²^,⁴(), WANG You⁵(), LI Huihui¹, MAO Mingtian¹^,⁶, WU Mian¹^,⁶, LU Chengguang¹^,⁶, TANG Jing¹, LIANG Suyun¹, GUO Zhanbao¹^,⁶, ZHOU Zhengkui¹, HOU Shuisheng¹(), TANG Yi¹^,⁶()

^1.Institute of Animal Science of CAAS，Beijing 100193，China
^2.Henan Agricultural University，Zhengzhou 450046，China
^3.Shandong Hekangyuan Biological Breeding Co. ，Ltd. ，Jinan 250001，China
^4.Anhui Qiangying Food Group Co. ，Ltd. ，Suzhou 235323，China
^5.Ringpu Bio-technology Co. ，Ltd. ，Tianjin 300308，China
^6.Shandong Agricultural University，Tai’an 271018，China

Received:2025-07-13 Online:2026-01-05 Published:2025-12-26
Contact: HOU Shuisheng, TANG Yi E-mail:libing_2025@163.com;237756683@qq.com;674913654@qq.com;wangyou@ringpu.com;houss@263.net;tangyi@caas.cn

摘要/Abstract

摘要：

目的 2021年8月以来，安徽、山东等地种鸭群出现不明原因产蛋下降，伴随精神沉郁、卵巢出血等症状。本研究旨在明确病原特征，为种鸭产蛋下降的防控提供依据。方法对2022年9月山东沂水采集的病鸭卵巢组织样品，使用鸭胚成纤维细胞（duck embryo fibroblast，DEF）进行病毒分离获得毒株后，利用第二代测序技术对病毒基因组测序，将所得序列与参考病毒基因库进行比对，以确定病原种类，并进一步分析病毒基因组结构，明确编码蛋白情况。依据测序得到的病毒序列设计特异性引物进行病原鉴定。将病毒基因与参考序列进行相似性比对和遗传进化分析，探究病毒遗传特征与进化关系。使用产蛋高峰种鸭开展回归试验，验证病毒致病性。结果病料样品接种鸭胚成纤维细胞后，细胞出现病变特征。全病毒基因库对比分析结果显示，样本中存在与环状病毒科密切相关的病毒序列，经序列拼接后命名其为鸭环状病毒（Duck orbivirus， DORV），其基因组由10个双链RNA片段构成，编码12种蛋白。PCR结果显示可特异性扩增出鸭环状病毒片段，并将分离毒株命名为DORV-SDYS。DORV-SDYS与帕里泻湖病毒（PLV）、科里帕塔病毒（CORV）和阿卡多病毒（ACAV）亲缘关系较近，它们之间VP5片段核苷酸序列相似性为80.1%~82.4%，氨基酸序列相似性为88.1%~91.1%。遗传特征分析显示，DORV-SDYS株在进化上具有独特性。动物回归试验表明，DORV-SDYS感染可导致种鸭产蛋率下降，并引起卵泡病理损伤。结论本研究从山东沂水地区产蛋下降病鸭卵巢组织中成功分离得到1株病毒，并将其命名为鸭环状病毒，明确了其全基因组编码区特征，证实鸭环状病毒感染是导致种鸭产蛋下降的病因，填补了环状病毒在水禽宿主致病性研究的空白，对水禽产业健康发展具有重要意义。

关键词: 鸭环状病毒; 种鸭; 蚊媒病毒; 产蛋性能

Abstract:

Objective Since August 2021， breeding duck flocks in Anhui， Shandong and other regions had experienced unexplained decreases in egg production， accompanied by symptoms such as depression and ovarian hemorrhage. This study aimed to clarify the pathogenic characteristics of the causative agent and provide a basis for the prevention and control of decreased egg production in breeding ducks. Method Virus isolation was performed using duck embryo fibroblasts （DEF） on ovarian tissue samples from diseased ducks collected in Yishui， Shandong， in September 2022. Next-generation sequencing technology was used to sequence the viral genome， which was compared with the reference virus genome database to determine the pathogen species. The viral genome structure was analyzed， and the encoded proteins were clarified. Specific primers were designed based on the sequenced viral sequences for pathogen identification. The viral genes were compared with reference sequences for similarity and phylogenetic analysis to explore the genetic characteristics and evolutionary relationships of the virus. Regression experiments were carried out using breeding ducks at the peak of egg production to verify the pathogenicity of the virus. Result After inoculating the diseased tissue samples into DEF cell， the cells showed typical cytopathic effects. Whole-virome comparison showed that there were virus sequences closely related to Orbiviridae， and after sequence assembly， it was designated as Duck orbivirus （DORV）. The genome consisted of 10 double-stranded RNA segments， encoding 12 proteins. PCR results confirmed that the pathogen in this study was DORV， and the isolate strain was named DORV-SDYS. The DORV-SDYS strain was closely related to Parry Lagoon virus （PLV）， Corriparta virus （CORV） and Acado virus （ACAV）. The nucleotide sequence similarity of the VP5 fragment was 80.1%-82.4%， and the amino acid sequence similarity was 88.1%-91.1%. Phylogenetic analysis showed that DORV-SDYS had distinct evolutionary characteristics. Animal regression experiments confirmed that DORV-SDYS could lead to a decrease in the egg production rate of breeding ducks， and caused pathological damage to ovarian follicles. Conclusion In this study， a virus was successfully isolated from the ovarian tissue of laying ducks with decreased egg production in Yishui， Shandong province， and it was designated as DORV. The characteristics of the full coding region of its genome were clarified. It was confirmed that DORV infection was the etiological factor causing decreased egg production in breeding ducks， filled the gap in the research on the pathogenicity of Orbivirus in waterfowl hosts， and was of great significance to the healthy development of the waterfowl industry.

Key words: Duck orbivirus; breeding duck; mosquito-borne virus; laying performance

中图分类号:

S858.3

李冰, 许明清, 郝东敏, 王友, 李慧慧, 毛明田, 吴冕, 鹿程光, 唐静, 梁素芸, 郭占宝, 周正奎, 侯水生, 唐熠. 1株导致种鸭产蛋下降的新型鸭环状病毒分离与鉴定[J]. 中国畜牧兽医, 2026, 53(1): 390-401.

LI Bing, XU Mingqing, HAO Dongmin, WANG You, LI Huihui, MAO Mingtian, WU Mian, LU Chengguang, TANG Jing, LIANG Suyun, GUO Zhanbao, ZHOU Zhengkui, HOU Shuisheng, TANG Yi. Isolation and Identification of a Novel Duck Orbivirus Causing Decreased Egg Production in Breeding Ducks[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2026, 53(1): 390-401.

图/表 15

表1

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参考文献 32

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病毒 Viruses	引物序列 Primer sequences （5′→3′）	长度 Length/bp	登录号 Accession No.
鸭环状病毒 DORV	F：GATACTGGAAGAGATGCTACA	565	PV871612
鸭环状病毒 DORV	R：CTGACGCTTGAGACACATA	565	PV871612
禽流感病毒 AIV	F：GACCRATCCTGTCACCTCTGA	346	PV950474.1、 PV949762.1
禽流感病毒 AIV	R：TGTCTGTGGGACCGATGCTGT	346	PV950474.1、 PV949762.1
鸭瘟病毒 DPV	F：GAAGGCGGGTATGTAATGTACA	447	OP502744.1
鸭瘟病毒 DPV	R：TCAAGGCTCTATTCGGTAATGATC	447	OP502744.1
鸭坦布苏病毒 TMUV	F：AAGCGAGCACCTACCATA	539	MK276456.1
	R：CAATTCCACCACGACAGT	539	MK276456.1

病毒 Virus	毒株 Strains	登录号 Accession No.	病毒 Virus	毒株 Strains	登录号 Accession No.
鸭环状病毒 DORV	SDYS	PV871612	帕里泻湖病毒 PLV	K71551	KU724114.1
非洲马瘟病毒 AHSV	RSA	ON809528.1	尤马蒂拉病毒 UMAV	IA08	PP669540.1
	2/E	KT030364.1		DE	MK100591.1
	7/E	KT030564.1		USA1969	HQ842624.1
蓝舌病病毒 BTV	BN96	JN671911.1	阿卡多病毒 ACAV	EthAr 1846-64	OL709425.1
	BTV17	MT952976.1	科里帕塔病毒 CORV	MP416-NA-2018	MW809644.1
	France	OR500249.1	科里帕塔病毒 CORV	AUS1960	KC853047.1
昌古尼拉病毒 CGNV	202 A	KY764793.1	中点环状病毒 MPOV	10088	MZ079850.1
	GBT 1144	KY659449.1		V9619	MZ079840.1
	D 50	KY659439.1		V9550	MZ079830.1
乔巴尔峡谷病毒 CGV	NEP1970	KP268789.1	云南环状病毒 YUOV	ON-4	LC585877.1
CHeRI环状病毒 CHeRIV	OV895	MT341506.1		JKT-10087	MF152992.1
CHeRI环状病毒 CHeRIV	OV926	MK903673.1		OV1288	MW424405.1

病毒 Virus	登录号 Accession No.	得分 Score
帕里泻湖病毒 PLV	KU724110.1	2 534
科里帕塔病毒 CORV	KC853046.1	1 219
科里帕塔病毒 CORV	NC_038566.1	1 219
阿卡多病毒 ACAV	OL709420.1	870
帕里泻湖病毒 PLV	KU724113.1	2 477
科里帕塔病毒 CORV	KC853047.1	1 214
科里帕塔病毒CORV	NC_038571.1	1 214
帕里泻湖病毒 PLV	KU724114.1	1 945

节段 Segments	编码蛋白 Encoded protein	蛋白功能 Protein function	开放阅读框长度 ORF length/bp	氨基酸长度 Amino acid length	蛋白质分子质量 Protein molecular weight/ku
1	VP1	RNA聚合酶	3 873	1 290	147.1
2	VP2	核心蛋白	2 850	949	108.5
3	VP3	外层衣壳蛋白	2 229	742	84.6
4	VP4	加帽酶	1 929	642	75.0
5	NS1	管状蛋白	1 779	592	69.2
6	VP5	外层衣壳蛋白	1 584	527	57.8
7	NS2	病毒包涵体蛋白	1 116	371	41.7
8	VP7	核心蛋白	1 068	355	39.3
9	VP6	螺旋酶	1 035	344	36.4
9	NS4	非结构蛋白	459	152	18.5
10	NS3	非结构蛋白	717	238	26.1
10	NS3a	非结构蛋白	318	105	12.3

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