新疆地区牛呼吸道疾病综合征主要病毒性病原流行病学调查

doi:10.16431/j.cnki.1671-7236.2026.01.036

Abstract

Abstract:

Objective Bovine respiratory disease complex （BRDC） is a multi-pathogen disease that can lead to high morbidity and mortality rates in cattle herds， causing severe economic losses to the cattle industry. To evaluate the viral pathogen infection in BRDC-affected cattle in Xinjiang， this study conducted viral pathogen detection on BRDC cases from six regions of Xinjiang. Method From January 2023 to December 2023， 561 nasal swabs were collected from cattle with respiratory symptoms in six regions of Xinjiang， including Yanqi， Kashgar， Changji， Bole， Ili and Aksu. PCR technology was used to detect seven common viruses causing BRDC， which were Infectious bovine rhinotracheitis virus （IBRV）， Bovine adenovirus type 3 （BAV-3）， Bovine coronavirus （BCoV）， Bovine rhinitis A virus （BRAV）， Bovine rhinitis B virus （BRBV）， Bovine viral diarrhea virus （BVDV）， and Bovine parainfluenza virus type 3 （BPIV-3）. The infection status of these seven pathogens in cattle of different seasons， in different regions and in different breeds was analyzed. Result The results demonstrated that all seven pathogens were detected. The detection rate was highest for IBRV at 14.4%， followed by BVDV at 13.0%， with the lowest detection rate observed for BAV-3 at 7.0%. Mixed infections were predominantly double infections （13.4%）， with the main pathogens including BAV-3+BCoV （1.8%）， IBRV+BPIV-3 （1.6%）， and BRBV+BVDV （1.6%）. Among triple infections （3.7%）， the highest detection rate was observed for IBRV+BPIV-3+BVDV （0.5%）. Quadruple infections （0.6%） and quintuple infections （0.6%） were also detected， such as IBRV+BRAV+BRBV+BPIV-3 （0.4%） and IBRV+BAV-3+BCoV+BRAV+BPIV-3 （0.2%）. There were significant differences in virus positivity rates across seasons， with the highest detection rate of BAV-3 in spring （11.0%）， BVDV in summer （34.0%）， IBRV in autumn （61.3%）， and BPIV-3 in winter （38.7%）. Geographically， the highest detection rate of BRBV was in Yanqi （50.0%）， BAV-3 in Kashgar （15.3%）， IBRV in Changji and Bole （28.8% and 22.6%， respectively）， BVDV in Ili （55.7%）， and an equal proportion of BRBV and BPIV-3 in Aksu （35.5% each）. Additionally， when categorizing the samples by cattle use into beef and dairy groups， dairy cattle were primarily infected with IBRV （29.5%）， while beef cattle were mainly infected with BVDV （12.9%）. Conclusion The investigation results showed that there were obvious seasonal， regional and breed differences in viral pathogen infection of BRDC in some areas of Xinjiang in 2023. This study would be helpful for formulating prevention and control strategies for BRDC in Xinjiang.

Key words: bovine respiratory disease complex; viral detection; mixed infection; epidemiological survey

CLC Number:

S852.65^＋3

HE Qin, LIU Xinbo, ZHEN Jie, FENG Qi, YI Pengfei, MA Yingcai, LI Na, WANG Xihu, ZHONG Qi, YAO Gang, CHEN Rulong, MA Xuelian. Epidemiological Survey of the Main Viral Pathogens of Bovine Respiratory Disease Syndrome in Xinjiang[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2026, 53(1): 402-417.

Figures/Tables 13

Table 1

Table 2

Table 3

Fig.1

Fig.2

Table 4

Fig.3

Table 5

Fig.4

Table 6

Investigation results of mixed infection of 7 viral pathogens in different seasons"

混合感染 Mixed infection	春季 Spring		夏季 Summer		秋季 Autumn		冬季 Winter
混合感染 Mixed infection	检出病毒 Detected viruses	检出率 Detection rates （95% CI）	检出病毒 Detected viruses	检出率 Detection rates （95% CI）	检出病毒 Detected viruses	检出率Detection rates （95% CI）	检出病毒 Detected viruses	检出率 Detection rates （95% CI）
二重感染 Double infection	BAV-3+BCoV	3.3（1.6，6.3）	BRBV+BVDV	6.3（3.1，1.9）	IBRV+BPIV-3	8.8（3.9，17.8）	BPIV-3+BVDV	4.8（1.3，14.4）
	BCoV+BRBV	1.8（0.7，4.4）	BCoV+BRAV	2.8（0.9，7.4）	IBRV+BVDV	3.8（1.0，11.3）	BCoV+BPIV-3	3.2（0.6，12.2）
	BAV-3+BRBV	0.7（0.1，2.9）	BRAV+BRBV	2.1（0.5，6.4）	BRAV+BPIV-3	3.8（1.0，11.3）	IBRV+BPIV-3	3.2（0.6，12.2）
	IBRV+BAV-3	0.7（0.1，2.9）	BCoV+BVDV	1.4（0.2，5.4）	IBRV+BRAV	3.8（1.0，11.3）	IBRV+BAV-3	3.2（0.6，12.2）
	BCoV+BRAV	0.40.02，2.3）	BCoV+BRBV	0.70.04，4.4）	IBRV+BRBV	3.8（1.0，11.3）	BRAV+BPIV-3	1.6（0.08，9.8）
			BPIV-3+BVDV	0.70.04，4.4）	BCoV+BRBV	2.5（0.4，9.6）	BAV-3+BPIV-3	1.6（0.08，9.8）
					BAV-3+BPIV-3	1.3（0.07，7.7）	IBRV+BVDV	1.6（0.08，9.8）
							IBRV+BCoV	1.6（0.08，9.8）
							BAV-3+BCoV	1.6（0.08，9.8）
三重感染 Triple infection	IBRV+BAV-3+BRBV	0.40.02，2.3）	BCoV+BRAV+BRBV	0.70.04，4.4）	IBRV+BRAV+PIV-3	2.5（0.4，9.6）	IBRV+BPIV-3+BVDV	4.8（1.3，14.4）
					IBRV+BCoV+BVDV	2.5（0.4，9.6）	IBRV+BCoV+BPIV-3	3.2（0.6，12.2）
					BCoV+BRAV+PIV-3	1.3（0.07，7.7）	BCoV+BPIV-3+BVDV	3.2（0.6，12.2）
					IBRV+BCoV+BRBV	1.3（0.07，7.7）	BRAV+BPIV-3+BVDV	3.2（0.6，12.2）
					BRAV+BRBV+BPIV-3	1.3（0.07，7.7）	BAV-3+BPIV-3+BVDV	1.6（0.08，9.8）
四重感染 Quadruple infection					IBRV+BRAV+BRBV+BPIV-3	1.3（0.07，7.7）
					BCoV+BRAV+BRBV+BPIV-3	1.3（0.07，7.7）
					IBRV+BRAV+BRBV+BPIV-3	1.3（0.07，7.7）
五重感染 Quintuple infection					IBRV+BAV-3+BCoV+BRAV+BPIV-3	1.3（0.07，7.7）	IBRV+BCoV+BRBV+BPIV-3+BVDV	1.6（0.08，9.8）
五重感染 Quintuple infection					IBRV+BCoV+BRAV+BRBV+BPIV-3	1.3（0.07，7.7）

Table 6

Fig.5

Table 8

Table 9

References 31

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组别 Groups		样本量 Sample size/份
地区 Regions	焉耆	10
	喀什	157
	昌吉	156
	博乐	133
	伊犁	88
	阿克苏	17
季节 Seasons	春季	275
	夏季	144
	秋季	80
	冬季	62
品种 Varieties	肉牛	388
品种 Varieties	奶牛	173

病毒 Viruses	靶基因 Target genes	引物序列 Primer sequences（5′→3′）	产物长度 Product length/bp	退火温度 Annealing temperature/℃	GenBank登录号 GenBank accession No.
IBRV	gB	F：CTCTACCGCACGGGCACCT	360	58	MK654723.1
IBRV	gB	R：GCGGCTCTCGTCTCGCA	360	58	MK654723.1
BAV-3	HEXON	F：TGCTTCTTGCAAACACGACG	827	55	NC_001876.1
BAV-3	HEXON	R：CATGTTAGCCGCCGAGAGAT	827	55	NC_001876.1
BCoV	N	F：TGTACCCTACTATTCTTGGTTCTCTG	596	55	MW711287.1
BCoV	N	R：TCTGCTTAGTTACTTGCTGTGGC	596	55	MW711287.1
BRAV	VP2	F：ATTACCAGCATCTTTACGCAA	411	55	MZ004695.1
BRAV	VP2	R：TCACCCACCACTCTAACATCTAT	411	55	MZ004695.1
BRBV	3D	F：ACACATTATCTTTTCCCGCAA	334	55	EU236594.1
BRBV	3D	R：AGAAGGCAGACCACCGTCTAT	334	55	EU236594.1
BVDV	5′-UTR	F：AGTCGTCAGTGGTTCGAC	201	47	KF501393
BVDV	5′-UTR	R：TCCATGTGCCATGTACA	201	47	KF501393
BPIV-3	HN	F：CGATGTCTTCAATCCCTGTT	409	55	KT071671.1
BPIV-3	HN	R：CCTGACAAATTCTGGAGATGTAC	409	55	KT071671.1

病毒 Viruses	预变性 Predenaturation	循环参数 Cycle parameters	循环数 Number of cycles/个	终延伸 Final extension
IBRV	95 ℃ 5 min	94 ℃ 30 s，58 ℃ 30 s，72 ℃ 30 s	35	72 ℃ 10 min
BAV-3	95 ℃ 5 min	94 ℃ 30 s，60 ℃ 30 s，72 ℃ 40 s	35	72 ℃ 5 min
BCoV	95 ℃ 5 min	94 ℃ 30 s，55 ℃ 30 s，72 ℃ 30 s	35	72 ℃ 8 min
BRAV	95 ℃ 5 min	94 ℃ 30 s，55 ℃ 30 s，72 ℃ 30 s	35	72 ℃ 8 min
BRBV	95 ℃ 5 min	94 ℃ 30 s，55 ℃ 30 s，72 ℃ 30 s	35	72 ℃ 8 min
BVDV	95 ℃ 4 min	94 ℃ 30 s，47 ℃ 30 s，72 ℃ 30 s	35	72 ℃ 10 min
BPIV-3	95 ℃ 5 min	94 ℃ 30 s，60 ℃ 30 s，72 ℃ 40 s	35	72 ℃ 5 min

维度 Dimension	奇异值 Singular value	惯量 Inertness	惯量比例Proportion of inertia/%	累积惯量比 Cumulative inertia ratio/%	标准差 Standard deviation	卡方统计量 Chi-square statistics	显著性 Conspicuousness
1	0.583	0.340	52.0	52.0	0.038	269.027	<0.01^a
2	0.521	0.271	41.6	93.6	0.037
3	0.204	0.042	6.4	100	—
总计Total	—	0.653	100	—	—

Epidemiological Survey of the Main Viral Pathogens of Bovine Respiratory Disease Syndrome in Xinjiang

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混合感染 Mixed infection	检出病毒 Detected viruses	检出率 Detection rates （95% CI）
二重感染 Double infection	BAV-3+BCoV	1.8（0.91，3.4）
	IBRV+BPIV-3	1.6（0.78，3.1）
	BRBV+BVDV	1.6（0.78，3.1）
	BCoV+BRBV	1.4（0.72，3.2）
	BCoV+BRAV	0.9（0.67，2.9）
	BPIV-3+BVDV	0.7（0.23，1.9）
	IBRV+BVDV	0.7（0.23，1.9）
	IBRV+BAV-3	0.7（0.23，1.9）
	BRAV+BPIV-3	0.7（0.23，1.9）
	BRAV+BRBV	0.5（0.14，1.7）
	IBRV+BRAV	0.5（0.14，1.7）
	IBRV+BRBV	0.5（0.14，1.7）
	BAV-3+BRBV	0.4（0.06，1.4）
	BCoV+BPIV-3	0.4（0.06，1.4）
	BAV-3+BPIV-3	0.4（0.06，1.4）
	BCoV+BVDV	0.4（0.06，1.4）
	BCoV+IBRV	0.2（0.01，1.2）
三重感染 Triple infection	IBRV+BPIV-3+BVDV	0.5（0.14，1.7）
	IBRV+BCoV+BPIV-3	0.4（0.06，1.4）
	BCoV+BPIV-3+BVDV	0.4（0.06，1.4）
	IBRV+BRAV+BPIV-3	0.4（0.06，1.4）
	IBRV+BCoV+BVDV	0.4（0.06，1.4）
	BRAV+BPIV-3+BVDV	0.4（0.06，1.4）
	IBRV+BAV-3+BRBV	0.2（0.01，1.2）
	BCoV+BRAV+BRBV	0.2（0.01，1.2）
	BCoV+BRAV+BPIV-3	0.2（0.01，1.2）
	BRAV+BRBV+BPIV-3	0.2（0.01，1.2）
	IBRV+BCoV+BRBV	0.2（0.01，1.2）
	BAV-3+BPIV-3+BVDV	0.2（0.01，1.2）
四重感染 Quadruple infection	IBRV+BRAV+BRBV+BPIV-3	0.4（0.06，1.4）
四重感染 Quadruple infection	BCoV+BRAV+BRBV+BPIV-3	0.2（0.01，1.2）
五重感染 Quintuple infection	IBRV+BAV-3+BCoV+BRAV+BPIV-3	0.2（0.01，1.2）
	IBRV+BCoV+BRAV+BRBV+BPIV-3	0.2（0.01，1.2）
	IBRV+BCoV+BRBV+BPIV-3+BVDV	0.2（0.01，1.2）

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